1、不開放FTP，購買者無法得到網站程序和數據，這樣就不能備份網站，將來也不能因為提供商服務不滿意而轉移網站；

2、不利于SEO優化，自助建站一般都沒有考慮優化推廣，僅僅能做展示所用；

3、操作并不簡單，而且很多圖片和內容無法修改，就算你有專業知識也無法通過修改文件的方式修改。

模板建站可以理解為自助建站，也有很多人現在把用CMS建站稱為模板建站，因為CMS一般都是由程序和模板風格組成的，CMS建站是行業發展的必要趨勢，因為CMS建站不僅可以節省成本，而且成熟穩定，可以根據行業的發展不斷升級到最新版本，最主要的是功能強大，一般成熟的CMS把該考慮的問題都給你考慮進去了。

而如果是按照用戶要求去開發網站風格即網站模板，CMS建站就和傳統意義上的手工建站一樣，而且價格、功能、安全等方面都優于傳統建站方式。